Program Pendidikan Agama Kristen membekali mahasiswa dengan pelatihan yang menggunakan kurikulum komprehensif. Kurikulum ini berfokus pada pedagogi, teologi Kristen dari tradisi Reformed, studi Alkitab, sejarah, hermeneutika, dll. Program Magang Wajib diintegrasikan ke dalam semester 7 untuk memberikan mahasiswa pengalaman mengajar. Tujuannya adalah untuk menghasilkan guru-guru misionaris bagi Indonesia yang memiliki pengetahuan sejati, iman kepada Kristus dan karakter yang saleh, sehingga mereka memiliki hati misi dan semangat juang yang berani untuk gerakan penginjilan dan doktrin yang sehat. Kurikulum ini juga bertujuan agar mahasiswa dapat mengenali dan berjuang melawan penyimpangan teologis yang melenceng dari iman dan kesetiaan Reformed, melawan pemahaman Alkitab yang ceroboh, dan melawan ketidaktahuan yang semakin meningkat, serta agar mahasiswa berupaya mengejar Amanat Agung.
